В случае, когда при синхронизации мод происходит формирование солитонного импульса, чрезвычайное усиление нелинейных эффектов приводит к дестабилизации импульса и выхода лазера из режима генерации солитонов. Для снижения нелинейных эффектов возможно использование волокон с большой площадью мод. Однако и в данном случае нелинейность сохраняется достаточно сильной по сравнению с твердотельными лазерами, как результат – допустимые к реализации энергии в случае оптоволоконных лазеров с синхронизацией мод значительно ниже.